捕鱼达人安卓版:本研究对其他作物群体基因组

项目组成员、中国农业科学院农业科学研究所研究员徐建龙介绍，目前关于水稻亚种籼稻(indica)和粳稻(japonica)的起源有两种假设:一种是单源假说，认为亚洲栽培水稻起源于一个单一的野生祖先，然后分化成籼稻和粳稻两个亚种，以适应不同的生态和地理环境;二是多元起源假说，即籼稻和粳稻分别起源于不同的野生祖先群。

2018年，带领完成“3000水稻基因组工程”，从三个主要方面揭示了水稻核心种质的基因组多样性:超过3200万个高质量snp(单核苷酸多态性);3 .有超过10000个水稻编码基因缺失突变;超过93000个结构突变。然而，作为水稻物种遗传多样性的另一个重要方面，水稻种质资源的功能单倍型(功能等位基因)基因编码区变异特征目前尚不清楚。

在最新的研究中，研究人员基于“日本裸”水稻参考基因组的注释信息和3010个水稻核心种质基因编码区非同义SNP数据构建了一个由45963个基因组成的全基因组基因功能单倍型。数据集;全面揭示亚洲栽培稻基因功能单倍型的自然变异特征，提出亚洲栽培稻的多源(驯化)假说，评估现代育种对全基因组功能单倍型多样性的影响。他们还开发了适用于全基因组关联分析和功能单倍型数据全基因组预测的软件包“hap”，这将为今后水稻基因基础研究和复杂性状有利等位基因的发现提供极大的便利，全面帮助水稻分子设计育种。本研究对其他作物群体基因组、功能基因组和设计育种研究也具有参考意义。